<html><head></head><body style="word-wrap: break-word; -webkit-nbsp-mode: space; -webkit-line-break: after-white-space; ">Ciao Stefano,<div>sono diversi anni che uso python per la mia attività di ricerca in campo bioinformatico e non ho mai avuto problemi. Ti consiglio di dare uno sguardo a questo tutorial orientato alla biologia molecolare <a href="http://ece.uprm.edu/~bvelez/courses/ComputingBioinformatics/Python/PythonCourseBioInformatics.pdf">http://ece.uprm.edu/~bvelez/courses/ComputingBioinformatics/Python/PythonCourseBioInformatics.pdf</a></div><div>Mi sento di suggerirti anche questi due titoli:</div><div>- <a href="http://shop.oreilly.com/product/9780596154516.do">http://shop.oreilly.com/product/9780596154516.do</a></div><div>- <a href="http://www.amazon.com/Bioinformatics-Chapman-Mathematical-Computational-Biology/dp/1584889292">http://www.amazon.com/Bioinformatics-Chapman-Mathematical-Computational-Biology/dp/1584889292</a></div><div><br></div><div>Ernesto <br><div> <br><div><div>Il giorno 19/mar/2015, alle ore 19.05, python ha scritto:</div><br class="Apple-interchange-newline"><blockquote type="cite">
<div class="xam_msg_class">
<div style="font: normal 13px Arial; color:rgb(0, 0, 0);">Grazie a tutti per le risposte. In effetti mi piacerebbe fare il bioinformatico e "vendere" i miei servigi a laboratori (coi quali in realtà già collaboro) che si occupano dei vari aspetti della biologia (genomica trascrittomica proteomica studio di sequenze modelli 3d )...dovrei quindi potermi occupare un po' di tutto....di strada devo percorrerne un bel po'!! <div><br></div><div><br>
<div><span style="font-family:Arial; font-size:11px; color:#5F5F5F;">Da</span><span style="font-family:Arial; font-size:12px; color:#5F5F5F; padding-left:5px;">: <a href="mailto:python-bounces@lists.python.it">python-bounces@lists.python.it</a></span></div>
<div><span style="font-family:Arial; font-size:11px; color:#5F5F5F;">A</span><span style="font-family:Arial; font-size:12px; color:#5F5F5F; padding-left:5px;">: "Discussioni generali sul linguaggio Python" <a href="mailto:python@lists.python.it">python@lists.python.it</a></span></div>
<div><span style="font-family:Arial; font-size:11px; color:#5F5F5F;">Cc</span><span style="font-family:Arial; font-size:12px; color:#5F5F5F; padding-left:5px;">: </span></div>
<div><span style="font-family:Arial; font-size:11px; color:#5F5F5F;">Data</span><span style="font-family:Arial; font-size:12px; color:#5F5F5F; padding-left:5px;">: Thu, 19 Mar 2015 15:34:42 +0100</span></div>
<div><span style="font-family:Arial; font-size:11px; color:#5F5F5F;">Oggetto</span><span style="font-family:Arial; font-size:12px; color:#5F5F5F; padding-left:5px;">: Re: [Python] Consigli per biologo</span></div>
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<div class="xam_msg_class">
<div dir="ltr"><div class="gmail_extra"><div class="gmail_quote">> 2015-03-19 8:54 GMT+01:00 Stefano Gasbarro <span dir="ltr"><<a href="mailto:python@gasbarro.eu" _djrealurl="mailto:python@gasbarro.eu" target="_blank">python@gasbarro.eu</a>></span>:<br><blockquote class="gmail_quote" style="margin:0px 0px 0px 0.8ex;border-left-width:1px;border-left-color:rgb(204,204,204);border-left-style:solid;padding-left:1ex">> Buongiorno a tutti ragazzi...mi presento sono Stefano da Roma e sono un biologo. ..é un pò che vi seguo ma non sono mai intervenuto. Prima di diventare biologo sono stato informatico per più di 10 anni ed ho un'infarinatura di programmazione. Mi sto approcciando a Python da poco e da "grande" mi piacerebbe fare il bioinformatico. Ho comprato la guida completa di Marco Buttu e la trovo ottima...mi servirebbe da voi un consiglio sugli strumenti necessari alla realizzazione di software per l'elaborazione dei dati scientifici...cosa usare per creare GUI...quali sono le potenzialità di Python per la biologia. ..insomma un quadro generale che vada oltre la mera programmazione. Vi ringrazio e conplimenti per la mailing list!</blockquote><div><br></div><div>> Ciao.</div><div><br></div><div>> Python è un buon linguaggio per la biologia, perchè è maturo e trovi molte librerie pronte.</div><div>> Per alcune di queste, ti basta una veloce ricerca "python biology":</div><div><br></div><div>> - NumPy</div><div>> - SciPy</div><div>> - Pandas</div><div>> - BioPython</div><div><br></div><div>> Addirittura c'è un libro:</div><div><a href="http://www.amazon.com/Python-Biologists-complete-programming-beginners/dp/1492346136" _djrealurl="http://www.amazon.com/Python-Biologists-complete-programming-beginners/dp/1492346136">> http://www.amazon.com/Python-Biologists-complete-programming-beginners/dp/1492346136</a><br></div><div><br></div><div>> Python però ha anche un grosso problema: non appeni esci "fuori dalle rotaie", ossia incominci a scrivere un algoritmo o simulazione numerica personalizzata, avrai un notevole calo delle prestazioni. Infatti tutte le librerie numeriche per Python hanno il "cuore" scritto in C o Cython.</div><div><br></div><div>> Quindi molto dipende da quello che devi fare.</div><div>> Se le librerie disponibili fanno quello che cerchi, sei a posto; lo stesso se non hai problemi a scrivere codice C o Cython.</div><div><br></div><div>> Altrimenti valuta anche un altro linguaggio.</div><div>> Il problema è che linguaggi *veramente* alternativi a Python sono molto recenti, mi riferisco a Go e soprattutto a Julia, quindi non è una scelta facile.</div><div></div></div><br></div><div class="gmail_extra">> Fai qualche prova e vedi con cosa ti trovi meglio.</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">> Per mia esperienza:</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">> 1) Se cerchi la comodità e la disponibilià di tools maturi: Python</div><div class="gmail_extra">> 2) Se cerchi un linguaggio ottimizzato per le applicazioni numeriche: Julia</div><div class="gmail_extra">> 3) Se cerchi un linguaggio ottimizzato per l'ingegneria del software: Go</div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra"><br></div><div class="gmail_extra">> Ciao Manlio</div></div>
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_______________________________________________<br>Python mailing list<br><a href="mailto:Python@lists.python.it">Python@lists.python.it</a><br>http://lists.python.it/mailman/listinfo/python<br></blockquote></div><br></div></div></body></html>