[PIPython] problemi con 1 script

[Paolo Mossino]

ciccio a unical.it wrote:

> Dato che ho a disposizione un cluster linux (una cinquantina di processori) 
> vorrei lanciare lo script indipendentemente su ciascun processore. Il comando 
> e' semplice bsub [opzioni] "python script.py".  
> Ho scritto un ulteriore script con un semplice loop per lanciare il comando 
> bsub n volte contemporaneamente. Il loop funziona, ma gli outputs si 
> sovrascrivono. Ho pensato, allora, di creare specifiche directory, ma quando 
> lancio lo script, questo non lavora all'interno delle directory. In altre 
> parole se creo diverse directory del tipo dir1 dir2 dir3 e lancio il comando 
> all'interno di ciascuna directory lo script funziona, se sono all'esterno no. 
> Ho provato a usare la riga python ~/dir1/script.py, ma non va'. Potete 
> suggerirmi un modo per entrare nelle directory ed avviare lo script? 

Comodo il cluster con LSF e relativo comandino bsub, vero? :)

Comunque, e' un problema di logica il tuo.

Devi spostarti PRIMA di eseguire il comando. Lo puoi fare da shell 
(incamsulata in un os.system) oppure da python:

os.system('(cd dir1; bsub python script.py)')

oppure

os.chdir('dir1')
os.system('bsub python script.py')

Meglio la seconda se vuoi fare uno script in Python... per usare la prima 
strada, tanto vale usare direttamente la bash.

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